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# 相同网络在不同状态下的比较 如果我有两个相同的代谢物网络（节点及边是相同的），但是它们是在不同的生理条件下得到的，我只能通过代谢物在不同状态下的 coefficient 来给边加权。在这种情况下，可以通过哪些属性，或者是什么方法来在网络上比较差异？ 要比较的是网络中的边权重的变化以及这种变化如何影响网络的整体属性和功能。在这种情况下，有几个网络属性和分析方法可以用于比较两个加权网络的差异： # 1. 边权重变化的比较 边权重差异：你可以直接计算每条边在两种状态下的权重差异，找出权重变化最大的边。这可以揭示哪些代谢物之间的相互作用在不同状态下发生了显著变化。 差异计算：可以通过简单的
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# 使用 Vue 3 + Element Plus 从头开始写一个数据库网站 - 04 - 后端服务搭建准备 由于 PrismJS 尚不支持 Vue 的语法高亮，因此 Vue 代码块均先使用 HTML 的高亮 2024-09-23 # 搭建本地测试数据库 # 安装 MySQL 并启动 下载 MySQL，以在本地搭建测试数据库。 以 8.4.2 LTS 版本为例，使用 MSI Installer 进行安装对新手来说比较便捷。 安装完成后，windows + R 输入 services.msc 打开服务，找到 MySQL84，右键启动 如果在安装过程中选择了启动 MySQL 服务，那么这个服务
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# 使用 Vue 3 + Element Plus 从头开始写一个数据库网站 - 03 - 编写第一个页面 由于 PrismJS 尚不支持 Vue 的语法高亮，因此 Vue 代码块均先使用 HTML 的高亮 2024-09-23 由于大家可能初学 Vue 3，为了先熟悉 Vue 3 和前端开发的流程，我们先来编写一些基本的前端页面。 在之前的教程中，我们已经了解了目录结构： ADDB/├── .vscode/ # 存放 VS Code 配置文件├── node_modules/ # 存放项目依赖包├── pub
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# 使用 Vue 3 + Element Plus 从头开始写一个数据库网站 - 02 - 项目初始化与开发环境设置 # 创建前端项目 # 安装 Node.js 和 pnpm 确保你已经安装了 Node.js，建议安装最新的 LTS 版本。 安装 pnpm，打开终端并运行以下命令： npm install -g pnpmpnpm 是一个快速且高效的包管理工具，相较于 npm 和 yarn，pnpm 具有更好的依赖管理效率。 # 使用 pnpm 初始化 Vue 3 项目 打开终端，使用以下命令创建新的 Vue 3 项目： pnpm create vue@latest在安装过程中，选择
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# 使用 Vue 3 + Element Plus 从头开始写一个数据库网站 - 01 - 项目介绍 # 项目背景 阿尔兹海默症（Alzheimer’s disease）是一种影响记忆和认知功能的神经退行性疾病，随着全球老龄化的加剧，其发病率逐年上升。为了支持科学研究与公众教育，开发一个专门的数据库网站显得尤为重要。本项目的目标是创建一个关于阿尔兹海默症相关生物标志物的数据库，具体目标包括： 数据收集：汇集有关阿尔兹海默症的各类生物标志物数据，包括其来源、相关文献和研究成果。 数据存储：通过高效的数据库管理系统，将这些数据有序存储，确保数据的完整性和安全性。 数据展示：设计友好的用户界面，便
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# 使用 Vue 3 + Element Plus 从头开始写一个数据库网站 - 00 - 大纲 # 项目介绍 # 项目背景 Alzheimer’s disease Biomarker 数据库网站简介 项目功能和目标：收集、存储和展示阿尔兹海默症相关生物标志物，并为公众提供查询与简单分析功能。 目标用户群体与预期的应用场景 # 技术栈介绍 前端：Vue 3 + Element Plus 后端：Node.js + Express 数据库：MySQL 包管理工具：pnpm 开发工具：VS Code # 项目初始化与开发环境设置 # 创建前端项目 使用 pnpm 初始化 Vue 3 项目
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# 银屑病单细胞数据 GSE151177 分析复现 文章标题为 Single-cell transcriptomics applied to emigrating cells from psoriasis elucidate pathogenic versus regulatory immune cell subsets（单细胞转录组学应用于银屑病迁移细胞阐明致病性与调节性免疫细胞亚群），发表在 Journal of Allergy And Clinical Immunology 上，IF14.2（2024） 数据为 GSE151177，文章提供了分析代码，但由于是 2021 年的文章，使用
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# 任务挑战 - PharmaNet 项目报告 CCF 开源创新大赛暨第二届 Bio-OS 开源开放大赛 参赛团队：BPG 2024 年 9 月 12 日 # 1. 项目简介 # 1.1. 项目背景 近年来，随着生物医学研究的飞速发展以及基因组学、系统生物学等学科的突破，药物、疾病和基因之间复杂的相互作用逐渐成为研究的重点。传统的生物医学研究往往集中在某一特定维度上，例如研究蛋白质 - 蛋白质相互作用（Protein-Protein Interaction, PPI）或药物与靶标相互作用（Drug-Target Interaction，DTI）关系，然而，随着越来越多的数据被积累，研究者们
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# GraphQL API 使用介绍：以 Open Targets Platform 为例 GraphQL 是一种强大的 API 查询语言，它允许客户端精确地指定所需的数据，从而优化网络请求和提高数据获取的效率。本文将通过 Open Targets Platform API 的示例，介绍如何使用 GraphQL API 进行数据查询。 # 理解 GraphQL Schema GraphQL API 的核心是其 Schema，Schema 定义了 API 中所有可用的查询（Query）、变更（Mutation）和订阅（Subscription），以及每个字段的类型和关系。Schema 可以被视为
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# REST API 和 GraphQL API 的联系与区别 API（Application Programming Interface，应用编程接口），通俗点说，就是不同软件之间的交流工具。它让我们可以从服务器获取数据或者把数据发送给服务器。目前常用的两种常见 API 是 REST API 和 GraphQL API。 # REST API REST API （Representational State Transfer API）是目前用得最多的一种 API 类型，它的原理很简单：通过 URL 来获取资源。 # REST API 怎么工作 我们可以把 REST API 想象成一个餐厅的菜